Macarena Baeza de la Fuente estudió actuación en la Escuela de Teatro UC entre los años 1990 y 1995. Los primeros años, se dedicó a la docencia y también a la actuación, montando algunas obras teatrales en compañías como actriz invitada, como también generando proyectos personales de teatro infantil (El traje nuevo del emperador) o de teatro barroco (La traición en la amistad). También desde los comienzos de su vida laboral desarrolló un trabajo de colaboración con los profesores y músicos Gina Allende y Sergio Candia, realizando en conjunto numerosas investigaciones y puestas en escena de teatro clásico y música antigua.
En el año 2001, dirige su primera obra: una versión de la tragedia Las troyanas de Jean Paul Sartre, que se tituló Esperemos el viento y que fue favorecida con el Fondart de ese año.
Desde ese momento, se va a dedicar casi exclusivamente a la dirección teatral y a la docencia. En el año 2003 funda con Sara Pantoja, Gina Allende y Verónica Barraza, la compañía de teatro e investigación La Calderona. El primer montaje sería Juana Inés de la Cruz, presentado tanto en Chile como en España.
En el campo de la docencia, ha impartido clases en las escuelas de teatro Facetas, Finis Terrae y Universidad Católica. Se ha especializado en la investigación del Teatro Antiguo, particularmente en el Teatro del Siglo de Oro Español y del Barroco Latinoamericano.
Actualmente imparte las asignaturas de Teatro Clásico, Actuación I y un curso de Historia del Teatro Antiguo. También es la directora de la compañía La Calderona y profesora de la Escuela de Teatro UC.